Os cursos de Ciências Biológicas da PUC-SP, Licenciatura e Bacharelado, apresentam Projetos Pedagógicos que oferecem ao Licenciando a possibilidade de desenvolvimento e aprimoramento de sua capacidade em operacionalizar os conhecimentos concernentes à sua área específica, partilhando com os Bacharéis os dilemas e as particularidades de trabalho que a área oferece. Esta preocupação da Faculdade de Ciências Biológicas a diferencia no cenário educacional local e nacional, garantindo à Pontifícia Universidade Católica de São Paulo identidade própria no contexto do Ensino Superior brasileiro.

Pautando-se por essas normativas a Comissão de Reforma Curricular do Curso de Ciências Biológicas elaborou um curso estruturado de modo que seu funcionamento se qualifique por um modelo de matriz curricular capaz de garantir a articulação entre a Licenciatura e o Bacharelado, além de promover a articulação entre os Cursos de Medicina e Enfermagem, por estarem lotados no Centro de Ciências Médicas e Biológicas. Assim, o Projeto Pedagógico do curso de Ciências Biológicas procura refletir:
    

• a garantia da identidade de cada um dos cursos (Bacharelado e Licenciatura), com troca contínua de experiências;
• a qualidade da formação da PUC-SP configurada pelo exercício de um modelo de prática de docência que utiliza a pesquisa como instrumento de ensino;
• a garantia de que a prática de docência ultrapasse o espaço físico da Universidade, respondendo às expectativas locais e nacionais.